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10 Mar. 2022

Une nouvelle méthode d'indexation

Une nouvelle méthode d'indexation

La méthode d'indexation Single STEP se met en place progressivement dans tous les pays du monde. L'Allemagne l'a adoptée l'an dernier pour la Simmental. En 2022, c'est au tour de la France. Toutes les races l'utiliseront d'ici la fin de l'année.

Les évaluations génétiques des bovins reposaient jusqu’à aujourd’hui sur deux étapes : une évaluation polygénique sur pedigree et performances, puis une évaluation génomique incluant tous les animaux ayant un typage. La nouvelle méthode d’indexation Single STEP permet d’évaluer tous les animaux, mâles et femelles, qu’ils soient génotypés ou non, en une seule étape avec l’ensemble de leurs informations disponibles (informations génomiques, performances, généalogies). Cette méthode permet ainsi d’optimiser l’utilisation des informations et d’améliorer la précision des résultats.

Un autre intérêt du Single Step réside dans l’intégration de la pré-sélection des animaux génotypés, notamment des taureaux, et évite, par conséquent, de sous-estimer le progrès génétique au cours des générations. Aujourd’hui seuls les meilleurs animaux génotypés ont des performances quelques années plus tard, les moins bons ayant été éliminés. Le Single Step prend en compte cette présélection.

Cette meilleure estimation du progrès génétique va donc avoir un effet immédiat sur l’estimation du potentiel génétique de vos animaux. Les jeunes candidats vont naturellement remonter en index. C’est particulièrement le cas pour les index lait et morphologie ou les jeunes générations reprennent en moyenne près d’un demi écart type, soit environ 300 kg de lait et 5 à 6 points d’index morpho. Vous ne serez donc pas surpris de voir vos génisses ou jeunes vaches prendrent quelques points sur ces caractères. Par contre, afin d’éviter les trop grandes variabilités d’ISU et conserver un écart type classique, les formules de l’index de Synthèse ont été ajustées en conservant le poids de chacun des caractères élémentaires.

Une étude appelée « Génoperf » a d’ailleurs été réalisée pour chaque race afin de valider cette nouvelle méthode d’indexation. Cette étude consistait à comparer les prévisions d’index en méthode Single Step, pour toutes les femelles génotypées en 2018, avec leurs performances ultérieures. 190 femelles Simmental ont été étudiées. Vous pouvez retrouver tous les résultats de cette étude dans le document joint. Les résultats sont spectaculaires. Performances et prévisions d’index sont parfaitement corrélées.

Si vous aviez encore des doutes sur le génotypage, cette étude viendra lever toutes vos inquiétudes. Le génotypage ça marche et l’indexation Single Step améliore encore la précision des évaluations génétiques. Les jeunes candidats Simmental génotypés gagnent encore 3 à 5 points de CD avec cette nouvelle méthode d’indexation.

Cette nouvelle méthodologie a aussi eu un impact sur les index de nos taureaux indexés sur descendance avec un reclassement de nos meilleurs géniteurs. JOYEUX est désormais le taureau leader de cette offre suivi par LEZARD (en photo ci-dessus) qui reprend 300 kg de lait et 0.5 points de Santé Mamelle. Les nouvelles valeurs de ces taureaux sont à retrouver sur notre site dans la rubrique offre génétique.

A signaler enfin que l’index Facilité de Naissance change de mode d’expression avec l’arrivée de cette nouvelle méthodologie. Ils seront désormais exprimé en base 100 comme nos partenaires allemands et autrichiens, et comme les index morpho. Ainsi un taureau à 88 (-1 écart type) sera difficile à naître. Un taureau à 112 et plus sera lui, conseillé sur génisses.

Fichiers :
GénoPerf